在一天一夜的追击中，明军软帆船舰队先后击毁4艘欧洲战舰及武装商船，并俘虏了另外3艘，仅有1艘法国船、1艘库尔兰船及1艘荷兰信报船侥幸从巽他海峡方向夺路而逃，然后一口气跑回了科伦坡第2舰队其实还有2艘在突破巽他海峡时受到重创的武装商船提起返航了，但这2艘船因为不能高速航行的缘故，所以，反而比后续3艘更晚抵达科伦坡港向荷兰殖民当局通报了第2舰队完蛋的噩耗。
按下成功逃跑的几艘欧洲船不说，九月十七日清晨时分，各路追击的明军舰船返回战场，协同留守部队对尝试恢复帆装未果的剩余荷舰发起了最后的进攻。
毫无还手之力的荷军第2舰队在又损毁了4艘武装商船、自沉2艘专业军舰后，被迫向数量远少于自己的明军软帆船队挂出投降白旗。
见到荷军第2舰队残余的舰船悉数投降了，潘龙和便命令以明军第一批次和第三批次建造的6艘软帆船押解投降荷舰前往新邾港直落巴塘解除武装；而剩余的12艘明军软帆船扬帆南下，直扑椰城港口，准备对目前停泊在椰城港口附近的81艘荷舰运输船、信报船实施毁灭性打击。
不过等12艘明军软帆船冲到椰城港口时，却发现荷军运输船似乎接到了第2舰队战败的消息，已经仓皇的逃离了椰城港口，甚至，为了逃跑，这些荷军运输船连岸上的荷兰陆军都没有通知，就那么头也不回的跑掉了。
潘龙和见状与参谋人员简单讨论了一下，便判定荷军运输船应该也是往巽他海峡方向逃走的，于是，明军软帆船队便向巽他海峡一线展开了追击，结果真的被明军追上并俘虏了其中的43艘运输船。
至于另外40艘荷军运输船中有6艘船比较大胆，在通过巽他海峡后没有向锡兰方向逃跑，而是先沿着爪哇南部海岸线向东行驶至拉图皇后湾palabuhanratu bay停泊了一段后再西行回逃，从而逃过了明军软帆船队的追击，顺利回到了锡兰，不过其中有4艘船没有返回科伦坡，而是直接回了印度老家。
剩下的36艘荷军运输船要么没有选择从巽他海峡突破，而是冒险走了苏门答腊东北北部海域逃亡马六甲，要么直接从爪哇北部海岸东进，奔帝汶岛方向的第1舰队而去，所以都未被明军软帆船队抓捕。
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然而，这36艘荷军运输船也并没有全部逃出生天，这不，从苏门答腊东北北部沿海逃向马六甲海峡的26艘船中，有15艘为郑家布置在林加岛周边的近海巡逻船所拦截俘获，有2艘误打误撞后进入了穆西河，被控制巨港及周边地区的淮藩兵马俘虏，只有9艘成功与荷军第3舰队实施了汇合，并把第2舰队失利的消息传递给了对方；而从爪哇岛北部海岸线东进的10艘船虽然侥幸与荷军第1舰队实施了汇合，但在后续作战中，却遭遇了明军赶来的淮丙船队，一样损失极大······