既然幕府把压力施加给了自己，板仓重昌就只能请九州的诸侯们替自己分担了，于是，他将任务分解给了九州联军，命令兵力最多的佐贺藩及佐贺藩的支藩莲池藩、小城藩承担进攻岛原城的任务，又命令拥兵1100势的小仓藩和拥兵1250势的中津藩负责进攻四阿山砦、拥兵1000势的石冈藩和拥兵1500势的柳河藩进攻南崩山砦，其余唐津、久留米、森藩、高锅藩等为预备队，视情况分别支援各处战场。
除了安排先期抵达岛原城周边的部队展开第三轮进攻外，板仓重昌还根据幕府物见队侦查队的报告，命令福冈藩、秋月藩、东莲寺藩、小仓藩等部沿岛原半岛西海岸南下，籍此迂回到半年南端，直扑原城周边地带，进而阻止起义军修建各处山砦，对原城一线来个黑虎掏心、一击必杀。
而在南九州方向，板仓重昌也致信充当南线讨伐军指挥官的萨摩藩继承人松平岛津萨摩守光久，催促他率兵出击天草群岛，剿灭南线的叛乱百姓。
按说，板仓重昌的计划还是周全的，但问题是，岛原半岛西线山谷纵横、道路极其不便，除非板仓重昌调来足够的船只运输，否则想要实现其快速南下、直扑起义军心腹要地的图谋是没办法实现的。
可船在哪呢？
别说，那些坐拥大型“回船”的日本豪商们对支援前线的义务避之不及，就算这些豪商们迫于幕府的压力，老老实实的向西路讨伐军提供船只，时间上也不及的很多豪商听说幕府讨伐军出击后，就已经把己方在九州地区船只调回本州了，等他们在接受幕府严令后，再把船调回来，黄花菜都已经凉透了。
既然没有船，山路又难走，所以，福冈等藩自然乐得敷衍了事，就这样，快速进军变成了慢速进军，所谓黑虎掏心的计划，自然是落实不下去了。
至于南九州方面，岛津守光肯定是要听命的，但他也有很好的借口，这就是天草群岛中除了上天草岛、下天草岛等2个主岛外，还有长岛、伊唐岛、狮子岛、御所浦岛、横浦岛、樋岛、汤岛、永浦岛、樋合岛、维和岛、大矢野岛、户驰岛、野釜岛等多个有人岛屿，至于无人岛的数量就更多了，因此为了避免有“漏网之鱼”，南线讨伐军需要逐一清查，但船一样没有那么多，因此没那么快“涤荡”干净了叛乱百姓的，也没那么快就直奔富冈城而去了。
两路兵马都在磨洋工，自是让板仓重昌气得吐血，但他又不能分身飞到西南两路去亲自押阵，所以，板仓重昌就只能把怒气撒在了近在眼前的东路讨伐军头上。
由于板仓重昌的不断逼迫，慑于幕府压力的东路诸侯便只好放弃了划水的企图，开始不惜代价的攻打起岛原城内外的起义军来了。