在最初的作战计划中，明军此次对荷作战，会在夺取巴达维亚后宣告结束，但郑家发现眼下的荷兰人似乎不堪一击，所以便起了得陇望蜀之意，决心顺势拿下马六甲城，以杜绝荷兰人未来以马六甲为基地，威胁移封到龙牙门的南安藩国。
当然，郑家的意图或许还不止这些郑家可能觉得在龙牙门岛上建城建港委实有些麻烦，不如直接夺了马六甲，籍此为南安藩基业但潘龙和在接受郑家出兵要求时，坚持在攻陷马六甲后，要彻底夷平了这座港口城市。
已经从琼州府城赶到龙牙门指挥建港建城建国工作的郑芝龙经过再三权衡后，觉得摧毁马六甲港城，对已经开始龙牙门建设工程的郑家有利无害，于是便最终接受了潘龙和的意见。
既然郑家依旧愿意遵照朱由崧规划的方案行事，潘龙和自然就不再阻挠郑家夺取马六甲的计划，就这样，在南北洋水师第二梯队夺取巴达维亚后的第三天，明军舰队出现在了马六甲港外。
而凑巧的是，明军舰队离开龙牙门的前一天，之前接受赏金，为郑家封锁马六甲港出过力的2艘英国船来到了龙牙门跟郑家讨尾款；郑芝龙爽快的付了尾款，又顺便问了一句英国人是不是愿意再赚一笔；英国人自然无不可，所以，2艘英国船也加入了明军的行列，再次出现在了马六甲外海。
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此前，马六甲的荷兰守军已经辗转从锡兰那边知道了大明攻打巴达维亚的消息乌波塔尔·波特维尔少校派出的通报船没办法直接走巽他海峡马六甲海峡这条线路，所以，走的是经由爪哇岛南部海域经苏门答腊西南部海域直接前往锡兰报警的线路，而锡兰那边知道了大明军队攻打马六甲的消息后，一方面向南非及国内报警，一方面又派船前往马六甲查询情况，这才让马六甲港知道了巴达维亚的情况很早就做好了战争准备。
不过，由于东南亚洋面上的荷兰船只不是已经被明军消灭了，就是已经启程返回欧洲了，所以，荷兰人没办法拼凑出任何一支像样的舰队来抵御明军对马六甲港的封锁，就只能龟缩在城内苟延残喘。
其实，明军目前也没有好的进攻办法来夺取马六甲港城明军目前没有陆师所以，明军舰队这边就只能一面用舰炮持续轰击马六甲河口处的河闸及位于圣保罗山东南麓的圣地亚哥城堡，一面紧急联络马六甲苏丹国的后裔柔佛苏丹。
“殿下，这是贵国夺回马六甲的最好机会了！”郑家的使者口灿莲花道。“大明有句老话叫做机不可失时不再来，贵国真要错失了这个机会，只怕未来会经常性后悔的。”
柔佛宰相穆罕默德·拉惹汗问作为郑家使者出访柔佛的洪旭道：“你们要我们做什么？我们能得到什么？我们又要支付给你们多少报酬？”
洪旭微笑着回应道：“贵国需要成为大明的外藩，向大明称臣纳贡；另外，还需要承认本藩对龙牙门等岛屿的领有，并且再将部分柔佛的土地移交给本藩！”
拉惹汗眼珠都鼓出来了：“这，这怎么可能！”