然而战斗进行到最激烈的时候，一路尾随顺军西进的渭源明军千人突然从侧后发起了进攻，李自成虽然留下了五千饥军盯防这股明军李自成之前也想提前伏击渭源出击的明军，但该部明军十分油滑，只是远远的吊着顺军，绝不轻易逼近，一旦发现顺军有伏击迹象还会做出撤退的架势，因此搞得李自成十分头脑，以至于为了不被这小股明军所牵制，李自成只能选择视而不见但人数是对手几倍的饥军完全不是渭源明军的对手，结果很快被击溃。
击溃堵防的饥军后，这股明军顺势杀向李自成的本队，李自成无奈之下只能被迫拆东墙补西墙，从前线调回部分顺军营兵前去抵御，但前线阵脚一动，已经到临界点的顺军军心也随之瓦解，于是乎，大批顺军莫名其妙的就高呼“败了”的口号，转身而逃，倒是让做好苦战准备的明军大吃一惊。
只是，明军很快清醒过来，开始痛打落水狗，而在明军的追杀下，顺军的战斗意志愈发衰落，就连都尉以上级军官也丧失了信心，调转马头后向渭河河谷两侧的山区逃去。
见到大势已去，李自成只好带着前卫也向山区逃遁，并就此消声灭迹了······
就在李自成兵败首阳关下的时候，李成栋又一马当先的从兰州赶到了狄道城下。
见到明军从兰州方向杀出，狄道顺军大哗，还不知情的将领便前往李自成处打探消息，结果发现李自成已经逃了，之前的命令都是刘芳亮代为发出的，由此，顺军立刻炸营了。
塔读@<app，^免费小说网站
随即，几万顺军纷纷向李成栋及狄道城内明军投降，而借着各路顺军向李成栋及狄道城内明军投降形成的混乱，刘芳亮带着数十名亲卫悄然的向西逃去，只是逃了没多久，不少刘芳亮的亲卫就后悔了，于是，这些后悔的刘芳亮亲卫便开始了合谋，最终在逃离狄道周边三天后，合谋者暴起袭击了刘芳亮及还忠于刘芳亮的亲卫。
在这次反叛中，刘芳亮和忠于他的亲卫统统被杀，随后反叛者割下刘芳亮的首级，带着刘芳亮的头盔、宝剑、侯爵大印、将旗等返回了狄道城，向稍后赶来的黄得功乞降。
由于没有在狄道军中发现李自成、袁宗第、高一功等顺军高层的尸体，黄得功便亲自审讯了这些背主的亲卫，但这些亲卫也不知道李自成、袁宗第等人那里去了，只是隐约知道李自成等人消失前，有一支小部队沿着洮河南下了。
不敢怠慢的黄得功便命令川军将领曾英率部南下追击，等前脚曾英离开了，后脚黄得功就得知了首阳关大捷的消息，并得到了李自成参与了首阳关之战的指挥、且消失在战败四逃的顺军中的报告。
黄得功便命令李成栋等人前往渭源与陇西之间搜寻李自成，自己则率着主力返回了兰州。
回到兰州后，黄得功一面命令马得功等人率军北上收复庄浪、凉州、镇番、山丹、甘州、肃州、西宁等河西各卫、所，一面又以相当兵力在临洮境内实施清剿，以确保没有躲藏起来的顺军残余。
可问题是，无论黄得功怎么清剿，始终找不到李自成的踪影。
而袁宗第、高一功部则翻越西倾山后，经由羊撒关、旧洮州寨临潭等地逃入了藏区，也暂时成了漏网之鱼，直到十年后，明廷的势力进一步渗透至西藏后，迫于明廷的压力，洮水上游的蕃部才将袁宗第等人交了出来，但这就是后话了······