明崇祯十六年、清崇德八年、西历1643年八月初九，皇太极像往日一样上朝下朝，处理国政，没有表现出任何异常的征兆；当天晚上，皇太极也如同以往一样，处理政务；但到了亥时2122时左右，死神却骤然降临在他身上“八月庚午，是夜亥刻，上无疾，端坐而崩”年仅五十有二。
年纪不大，没病没灾，皇太极就这么没了，因此关于皇太极的死亡，便有了四种推测。
第一种推测，认为皇太极是活活累死的，因为当时正值满清入关前夕，明朝局势已经大厦将倾，皇太极在频繁的政治和军事活动中积劳成疾，因此精力耗尽而猝死。
第二种推测，认为皇太极是死于疾病，因为皇太极是个大胖子，还爱吃不加盐的肥猪肉，这样的人容易换上心血管疾病，因此极有可能是“卒中”后来不及抢救而死；当然，认为皇太极死于疾病的人还有一种相近的推动，即皇太极死于“痰疾(一种热病)”。
第三种推测，认为皇太极是因为宠妃博尔济吉特·海兰珠之死，悲伤过度，痛心而死。
第四种推测，则是认为皇太极极有可能死于一场政治谋杀，凶手可能是多尔衮兄弟。
哪种推测是正确的，谁也没办法确定，但有一点可以肯定的是，由于皇太极去世太过突然，没有留下任何的政治遗言，因此，他一死，便导致了清廷内部的政治空白，引发了清廷内部两大政治势力的激烈斗争。
其中，直属于皇太极和皇太极长子豪格的两黄旗及正蓝旗大臣坚决要求以汉族皇位继承制度中的有子先立子、无子再由兄弟承袭的传统其实汉族皇位承袭传统并非绝对是这样的顺序立皇太极之子为满清嗣皇帝，但两白旗大臣和一部分两红旗宗室却以多尔衮年富力强且原为努尔哈赤属意的理由，坚决拥立多尔衮为满清新的皇帝。
在郑亲王济尔哈朗所代表的镶蓝旗，及两红旗旗主代善没有明确自身态度之前，双方争的面红耳赤，甚至还拔刀相向，差一点大打出手。
由于没办法得到出两白旗以外，其余六旗的支持，多尔衮自觉成为皇帝的条件还不成熟，所以经过暂时权衡之后，退而求其次的表示自己可以不当满清皇帝，但豪格也不能当嗣皇帝。
此前，豪格为了表示大肚和没有私心，曾经失言称只要是皇太极的儿子继位，自己可以不当满清嗣君，现在这句话被多尔衮拿出来挤兑豪格，一下子就把豪格顶在杠头上。
豪格哑口无言了，但两黄旗大臣们还想忠心救主，只是为了避免八旗分裂，满清内耗灭亡，中立三旗的宗室、大臣纷纷表示多尔衮的提议很好，是解决问题的态度，因此，在中立三旗的压力下，豪格出局了。
豪格出局后，一众满八旗权贵便拥立皇太极的第九子、年仅六岁的福临即帝位，并改元顺治；顺治皇帝继位后，因为其年纪太小，没有执政能力，因此为了避免豪格以长兄身份操纵朝局、乃至对幼弟暗下毒手，所以代善等人还推举郑亲王济尔哈朗和睿亲王多尔衮为辅政，由此稳定了皇太极死后的满清国内局面。
虽然，日后多尔衮排挤济尔哈朗、借牢狱杀死豪格、不断打压两黄旗大臣、权威形同皇帝，但满清皇位却再未易手······
皇太极去世，顺治继位的消息传到怀庆府的时候，福王已经进入了弥留之际，朱由崧日夜守候在福王身边，以备不时。
当年八月二十日深夜，朱由崧突然听到福王的召唤，朱由崧当即起身来到福王床边，只见福王脸色红润的冲着朱由崧招招手，朱由崧立刻眼角流泪的走了过去。