汪文言案算是平息了，但东林党人开始后怕和意难平了，于是为了一劳永逸的清除掉阉党这个政治对手，杨涟便凭着自己曾经在移宫案中的“出色”表现和士林影响力，准备上疏一举掀翻魏忠贤这块阻碍东林党彻底控制大明朝局的绊脚石！
恰好此时，魏忠贤因为率着宫内净军操练时，骑马奔于御前，被天启帝一箭射杀奔马，然后命其回家思过，暂时不在天启帝身边，因此，杨涟就觉得彻底清算阉党的机会来了。
这不，天启四年六月初一，杨涟便正式向通政司递交了弹章，弹劾魏忠贤有24项大罪。
这24项大罪林林总总，归纳起来，比较重要的有“亲乱贼而仇忠义”、“颠倒铨政、掉弄机权”、“横行宫内、谋害嫔妃”、“滥邀恩荫”、“要挟无穷”、“操纵东厂”、“快私仇、行倾陷”、“恩多成怨”、“进有傲色、退有怨言、朝夕提防、介介不释”等罪名。
此外，杨涟还在奏疏中声称，“凡此逆迹，昭然在人耳目，乃内廷畏祸而不敢言，外廷结舌而莫敢奏，间或奸状败露，则又有奉圣夫人为之弥缝，甚至无耻之徒，攀附枝叶，依托门墙，更相表里，迭为呼应，积威所劫，致掖廷之中，但知有忠贤，不知有陛下，都城之内，亦但知有忠贤，不知有陛下”
最后杨涟在奏疏中明确要求道：“陛下春秋鼎盛，生杀予夺，岂不可以自主？合围受制么髍小丑，令中外大小惴惴莫必其命？伏乞大奋雷霆，集文武勋戚，敕刑部严讯，以正国法，并出奉圣夫人于外，用消隐忧，臣死且不休”
杨涟这份煌煌之作，可以说攻击的火力是相当猛烈的，以至于居家的魏忠贤听说之后，非常的害怕，于是试图请内阁次辅韩爌出面调解自己与杨涟的矛盾。
但韩爌身为东林党人，自然是站在杨涟一边的，因此严词拒绝了魏忠贤求和的企图：“非也，吾不能！祸由公公自身起，还请自便！”
魏忠贤真的没想到，自己几乎是卑躬屈膝的上门请求韩爌的帮助，居然落了一个被韩爌嘲讽的结果，因此，差一点当场就气晕了，但魏忠贤毕竟做过了几年的御马监太监和司礼监秉笔，好歹也是有一些城府的，所以，最终也只是寒着脸从韩爌处离开的，而没有当场跟韩爌这个次辅翻脸。
可是，韩爌不愿意出面调解，这事就遮掩不住了！
所以，无可奈何的魏忠贤只好跑到天启帝面前哭诉东林党对自己的迫害：“皇爷，您是知道奴婢是个本分人的，这二十四条大罪，奴婢怎么能生受的起啊！皇爷，杨涟他们，他们是要老奴的命啊！皇爷，看在奴婢多年鞍前马后伺候的份上，给奴婢一条生路吧，奴婢，奴婢愿意交卸了司礼监秉笔和提督东厂的差事，只求能回肃宁老家养老”
“你个老货，哭什么，真以为朕是三岁小儿，别人一哄，便着了别人的道吗？”看在魏忠贤声泪俱下的表演，天启帝抬脚踢了踢跪在自己面前的魏忠贤。“别跪着了，起来说话！”
魏忠贤颤颤巍巍的爬了起来，就听天启帝指着杨涟的奏疏说道：“你有没有罪，该怎么处置，稍后再说，你先为朕解释一下，这个指使宦官，三五成群到内阁威逼阁臣按其意愿拟旨，或不经票拟、径自内批，坏祖宗二百余年之政体是怎么回事啊？”