但壕镜领土主权仍属于大明。
故当时大明朝廷为了有效管理越来越繁华的壕镜，逐步在壕镜设置衙门、官员，驻扎军队，对澳门事实军事、政治上的控制。
其在行政上，将壕镜划归广州府香山县管辖。
由香山县派驻官吏，设置提调、备倭、巡缉三个行署，负责壕镜治安，不论是明人还是葡萄牙人，在壕镜犯罪皆由大明官吏按大明律法条规处置。
又指派海防同知进驻壕镜，负责壕镜防务。
后来更是将市舶司移到壕镜，方便收税，并对澳门的商业进行一定管控。
上述各个衙署官员，被统称为守澳官壕镜当时又被称为壕镜澳。
如果大明制定的这些针对壕镜的措施规制都能切实执行，葡萄牙人就真的只是壕镜租客而已，跟后清朝时的租界本质完全不同。
可惜，再好的规制，执行的人不行，国家实力衰弱，它便会如同一纸空文。
又过数十年，到了万历后期，葡萄牙人眼见大明国力、军势由盛转衰，野心便再次膨胀。
为了获取壕镜的统治权，他们开始私下招募日本浪人作为打手，建筑城垣，重新假设炮台。
同时还接纳大明朝廷明令禁止来贸易的日本商船，展开对日贸易。
此时期，大明这边也有官员注意到壕镜葡萄牙人的野心及异动，针对性地进行打压、管控。
如香山县县令蔡善继曾在万历三十六年1608趁壕镜葡萄牙人内乱，派兵进入平乱，并制定了《制澳十条，对违法葡萄牙人严厉惩处。
万历四十一年1613，广东巡海佥事喻安性驱逐了葡萄牙人蓄养的倭奴、日本浪人，并警告葡萄牙人不得再如此做。
之后又请两广总督张鸣冈、巡按周应期制定了《海道禁约，责令葡萄牙人必须遵守，以维护大明在壕镜的主权及正当权益。
可惜，后面先是有万历后期努尔哈赤反于辽东，大明在萨尔浒大败。
到了天启朝大明在辽东不断战败失地，天启末又有西南奢安之乱。
崇祯朝则是天灾连连，多省农民因活不下去揭竿而起，成为流寇肆虐各地，可以说内忧外患，虚弱不堪。
这种情况下，对壕镜的掌控力自然是跌到了谷底。
朱媺娖在南京继位为帝后，除了从壕镜将原市舶司迁走，改名海关，只在壕镜留以海关所，并没有针对壕镜做别的措施。
葡萄牙人虽然远比其他西方人更了解大明，壕镜的葡萄牙人甚至多半有些汉化，跟大明官员、士绅也多有勾连，知道这几年大明国力蹭蹭上升，军事上也取得了一系列胜利，威震四方。
可是贪婪还是让他们没有吐出已经到嘴里的“食物”。
及至大明和荷兰谈判之事定在壕镜，里面的葡萄牙人的炮台等军事设施依旧没有拆毁，很多葡萄牙人蓄养的倭奴、浪人也没有驱逐，视大明此前制定的诸多条规为无物。
这种情况朱媺娖是不能忍的，但又觉得不至于调动大军进行一场战争。
于是便下旨给陈际泰等负责与荷兰谈判的官员，让他们在谈判之前先顺手将壕镜的问题解决了。
一则，若让荷兰瞧见葡萄牙人在壕镜俨然主人的模样，怕是会轻视大明，由此给后面的谈判增加难度。
二则，便是给荷兰人挖坑——你之前不是不想在大明控制的地方东蕃岛谈判吗？以为改在壕镜就能避免了？
我就是让你知道，壕镜也是我大明的，你只能在我大明控制的地方谈判！